La Chiesa di San Giovanni Battista in Ceccano, con titolo di Collegiata, si presenta in stile settecentesco e conserva ancora oggi notevoli reperti della chiesa medioevale di cui è il rifacimento. 
Nella Cronaca di Fossanova infatti, è ricordata l’ordinazione di un diacono nella chiesa di San Giovanni di Ceccano, nel 1141, pochi decenni dopo, il 7 ottobre del 1182, la chiesa bruciò in un incendio insieme a tutta la parrocchia: “1182 Peccatis exigentibus Ecclesiae S. Ioannis de Ceccano combusta fuit cum sua parochia.”
Subito riedificata, nel 1196 diede alloggio al Vescovo di Anagni, venuto a Ceccano per la consacrazione della chiesa di S. Maria a Fiume: “Dominus Epus Anagninus ad Ecclesiam S. Ioannis.”
Anche nel testamento del conte Giovanni di Ceccano, datato 1224, viene spesso fatta menzione dell’arciprete di S. Giovanni.
Nei secoli seguenti, se ne ha memoria nell’archivio comunale di Ferentino, per la consacrazione che ne fece nel 1587 Monsignor Silvio Galassi.

L’attuale Chiesa, come indicato in un atto consiliare di Ceccano del 1751, fu costruita su disegno dell’illustre architetto Giovan Battista Nolli.
Gregorio XVI, con bolla del V Idus Septembris 1845, la dichiarò chiesa collegiale.
In questa chiesa è possibile ammirare il quadro raffigurante la decollazione di S. Giovanni Battista, la cui realizzazione è da attribuirsi a Guercino da Cento, secondo alcuni, al Sacchi di Nettuno o a Luca Signorelli, secondo altri.

Giovanni il Battista (Giovanni il Precursore), in latino “Ioannes Baptista” fu un asceta proveniente da una povera famiglia sacerdotale ebraica originaria della regione montuosa della Giudea e fondatore di una comunità battista che fu all'origine di alcuni movimenti religiosi del I secolo d.C. come la comunità giudaica non rabbinica fondata da Gesù di Nazareth e le comunità gnostiche samaritane fondate da Dositeo, Simone Mago e Menandro.
Giovanni Battista, venerato da tutte le chiese cristiane e considerato santo da tutte quelle che ammettono il culto dei Santi, è una delle personalità più importanti dei Vangeli. Secondo il Cristianesimo, la sua vita e predicazione sono costantemente intrecciate con l'opera di Gesù; insieme a quest'ultimo, Giovanni Battista è presente anche nel Corano come uno dei massimi profeti che precedettero Maometto. Morì intorno al 35 d.C.

Patrono di Ceccano, S. Giovanni Battista dovette essere uno dei primi Santi venerati dai vecchi cittadini fabraterni.